L’insieme di tutti i trascritti in un organismo è chiamato trascrittoma.

Le nostre soluzioni RNA -Seq includono:

RNA- Seq o Whole Transcriptome Shotgun Sequencing

È un servizio di analisi del trascrittoma che permette il profiling dell’espressione genica e la caratterizzazione dei trascritti codificanti e non codificanti. Fornisce informazioni complete su varianti di splicing e geni di fusione.
Analisi dei dati:

  • Identificazione delle differenze nell’espressione genica tra campioni controllo e campioni trattati
  • Identificazione delle differenze nello splicing alternativo tra campioni controllo e campioni trattati
  • Annotazione funzionale nella espressione differenziale genica
  • Individuazione di nuovi Trascritti Putativi

 

De novo Transcriptome Assembly

Permette lo studio di qualsiasi organismo senza alcuna conoscenza preliminare della sequenza.
Analisi dei dati:

  • Assemblaggio dei Trascritti
  • Predizione degli ORF (open reading frame)
  • Predizione di geni
  • Predizione RNA non codificante

 

Small RNA Sequencing

Le piccole molecole di RNA svolgono un ruolo cruciale nella regolazione dell’espressione genica. Le nostre tecnologie permettono la scoperta ed il profiling di ogni forma di piccoli RNA non codificanti.
Analisi dei dati:

  • Expression Profile
  • Novel SmallRNA
  • Predizione dei Target di noti e nuovi miRNA

Progetti in corso

  • Cellular and Viral SmallRNA profling of HCMV-infected Burkitt Lymphoma and Plasmacytoma cell lines
  • Differential Gene Expression of HumanMelanoma Treated Cell lines
  • Differential Gene Expression of Zebrafish cell lines after probiotic supplementation
  • Paired End Sequencing of mosquitoes RNA